Wenn Du zwei Avis zusammenfügen willst, dann müssen die auch wirklich 100%ig zu einander passen (vom Codec, FPS und Bildformat aus betrachtet).
Ansonsten wird es halt ein paar Probleme geben.
Avi ist an sich kein Format wie z.B. MPEG. Avi ist nur ein Container, in dem sich alles mögliche verstecken kann. (Film codiert in Cinepak, Sound in MP3 oder ein Teil in DIVx und ach weiß der Geier :-))
Manchmal hilft halt nur decodieren und dann zusammefügen und encodieren.
Tja, wenn Du schon alles ausprobiert hast, dann hilft wahrscheinlich nur die Filmchen zu demuxen und anschließend die Filmdateien zusammenzuführen und den Ton dazu zu muxen.
Aber das geht schon wirklich sehr in den Bereich von VirtualDub / Goldwave (beides teilweise Freeware rein (oder meinetwegen auch Premiere etc.).
So ein 0815 Prog wird's dann auch nicht mehr reißen.